当一个企业注销后，其持有的软件著作权该如何处理呢？可以根据以下几个方面进行考虑：

1. 检查软件著作权的登记状态

在注销企业之前，需要先检查该企业持有的软件著作权是否已经登记，并确保登记信息的准确性。如果软件著作权登记信息错误或者不完整，需要及时更新或者补充。

2. 进行软件著作权的转让

企业注销后，其持有的软件著作权也需要进行转让。可以将软件著作权转让给其他企业或者个人，也可以将其捐献给政府或者其他机构。

3. 软件著作权的继承

如果企业注销后，其持有的软件著作权没有进行转让或者捐献，那么软件著作权将会继承给企业的继承人或者法定代表人。但是，这也需要在注销企业前进行相关规划和安排。

4. 软件著作权的保护

无论是软件著作权的转让还是继承，都需要对其进行保护。可以通过专业的法律人员进行咨询和协助，确保软件著作权的法律地位和权益。

总的来说，企业注销后软件著作权的处理需要谨慎和详细的规划和安排，以确保软件著作权的合法性和权益。